Agonyn puutarha on Euroopan valtaa pitävien hirvittävä luomus, jossa kohtaavat kaksi tuhoon tuomittua ihmisryhmää; Kiinalainen kulttuuri ja Eurooppa.
Tri Antoine Durleux, etevä, mutta erikoisen mielenlaadun omaava lääkäri, päättää nopeasti jättää Pariisin välttääkseen skandaalin. Laivamatkalla, kohti pakoa hän tappaa Clara Greenhillin.
Nämä kaksi vastakohten ihmistä rakastuvat toisiinsa eivätkä voi enää erota. He kokevat vihan, rakkauden, intohimon, nautinnon ja perverssion. He joutuvat kokemaan kauhua ja verta. He joutuvat painajaismaiseen eroottiseen maailmaan, josta paluu on mahdotonta...