Troijan sota on loppunut. Kaikki Troijan sotilaat ja prinssit on tapettu. Valloittajat haluavat hajoittaa viimeiset Troijan rippeet eli erottaa äidit ja lapset toisistaan. Elokuva koostuu kolmesta tarinasta, joista jokainen perustuu erotettavien naisten vahvuuteen. Cassandra (Genevieve Bujold), Andromache (Vanessa Redgrave) ja Helen (Irene Papas). Kaikki kolme hahmoa liittyvät elokuvan keskushenkilöön Hecubaan (Katherine Hepburn), Kuningatar, joka sankarillisesti kestää traagiset tapahtumat.
Vaikkakin Troijan Naisten tapahtumat onkin sijoitettu sodan jalkoihin, on elokuva kerronnallaan voimakkaasti sodan vastainen.